天顺八年(1464)七月二十日，吴氏被封为皇后。朱见深的正式婚姻是包办的，皇后吴氏大有来头，父亲是羽林前卫指挥使吴俊，舅舅是曾在曹吉祥叛乱中救过朱祁镇命的怀宁侯孙樘，堪称将门虎女。
孝宗即位以后，念及吴皇后的恩典，这位心高气傲的小姐只当了几个月的皇后，就被冷落在深宫许多年，此时已经是年华逝去，人老珠黄。朱佑樘也把她请了出来，当作自己的母亲来奉养。被遗弃二十多年的吴废后感动得老泪横流，也许她当年的动机并不是那么单纯，但对于朱佑樘而言，养育之恩是必须报答的，其他的事情并不重要。下令吴皇后的穿着和膳食都按照太后的制度供应，把吴皇后的侄子任命为锦衣卫百户。吴皇后风雨一生，晚年也算是因为当年的善举得到善报。明孝宗无愧一个孝字，对待废后都能如此，何等不易。武宗正德四年，吴皇后去世了，太监刘瑾说烧了算了，按照去世宫人的例子一埋。大学士王鏊说，这是绝对不行的，上书武宗皇帝，武宗皇帝觉得吴皇后对孝宗有抚育之恩，但是被祖父宪宗废除，不能合葬在茂陵，就同意按照王鏊的建议，用妃子的葬礼制度，安葬在上京金山。
万贵妃所生长子夭折。所以所有怀孕的妃子或宫女都被万贵妃逼迫堕胎了。纪妃的孩子（明孝宗）在众人的隐瞒下活了下来，纪氏害怕皇子被害，偷偷养育，不敢声张，吴皇后也时常接济帮助。
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